精灵升级后不仅会提升基础属性，还会解锁或强化特定技能，这些新技能往往能显著改变战斗策略。升级后的技能通常分为攻击型、防御型和辅助型三类，攻击型技能可能增加多目标打击效果或附加异常状态，防御型技能会提供护盾或减伤机制，辅助型技能则可能包含治疗、增益或控制效果。需不同精灵的升级技能路径存在差异，部分稀有精灵在达到高等级时会解锁专属特效技能。
精灵进化作为升级的高级形态，会彻底改变技能组的结构。第三形态进化后，部分精灵将获得战斗复活能力，复活时恢复100%生命值并重置部分技能冷却时间。这种质变型技能需要消耗特定进化魂石激活，且每次战斗通常仅能触发一次。进化后的技能特效往往伴随视觉形态变化，例如雷伊的黄金盔甲在进化后会附带电流环绕效果，这些视觉效果并非单纯装饰，而是与技能触发概率或伤害加成存在关联。
技能进阶系统在升级到特定阈值后开放，允许玩家对核心技能进行定向强化。进阶后的技能可能缩短冷却回合、提升暴击率或增加特殊效果触发概率，例如将普通眩晕效果升级为无视抗性的强制控制。该系统的资源消耗与精灵星级成正比，五星精灵的技能进阶需要消耗更多高级突破石。部分特殊技能在进阶后会改变作用机制，如从单体攻击转变为穿透一列的线性攻击，这种变化需要重新调整队伍站位策略。
特性系统与等级提升存在联动机制，高等级精灵通过洗练可获得稀有战斗特性。瞬杀特性虽然触发概率较低，但能直接秒杀非免疫目标的特性使其成为BOSS战的核心策略选项。特性洗练需要消耗基因药剂，这些资源主要通过钻石购买或宝箱获取。特性效果不受技能等级影响，但高等级精灵的特性触发基数更高，这使得等级与特性形成互补的战斗增益关系。
合成系统允许将五个同星级精灵随机合成为更高星级单位，这种升级方式会继承主精灵的部分技能并附加暴击增益。合成产生的技能变异存在特定规律，例如攻击型精灵合成后必定保留一个原始攻击技能，同时有概率获得副精灵的被动效果。该系统在后期能产生超越常规升级强度的特殊技能组合，但需要消耗大量同品质精灵作为材料。
