要进入千来神祠地下遗迹，首先需要传送到鹤观岛的知比山传送锚点。从知比山中间位置向下飞行，利用风之翼滑翔至底部，这是进入地下遗迹的主要路径。到达底部后，沿着布满蜘蛛网的通道前进，穿过由电气机关控制的石门即可进入遗迹内部。这一过程中需注意避开障碍物，确保顺利抵达目标区域。
进入通道后，会遇到多个机关谜题，其中部分需要激活雷元素方碑或调整机关颜色才能继续前进。某些石门需通过升高或降低机关来改变光线颜色，从而解锁通路。建议携带雷元素角色以应对解谜需求，同时注意观察周围环境中的雷鸟雕像和雷立方体，它们往往是解谜的关键线索。耐心解开这些机关后，即可深入遗迹核心区域。
千来神祠地下遗迹内还隐藏着壁画解谜任务，需使用特定道具如羽毛进行互动。部分壁画位于建筑最下层，需通过特定路径抵达。遗迹内分布着多个宝箱和雷灵，跟随雷灵移动或击败守卫敌人可获得额外奖励。探索时建议优先清理周边敌人，避免干扰解谜过程。
若需进入水下洞窟区域，需在千来神祠下方激活石像机关，随后启动左侧的启动器使潮水退去。退潮后沿楼梯下行即可进入洞窟。洞窟内同样包含隐藏宝箱和谜题，需仔细探索。完成所有解谜后，千来神祠地下遗迹的核心区域将完全开放，玩家可进一步挑战其中的隐藏任务或收集稀有资源。
探索时建议优先标记关键点位，以便高效完成目标。
